卢定军接到了军统戴局长的命令，要其好好保证沈冰的安全。于是，卢定军不得不暂缓对沈冰的捕杀。高飞带封格格来到了他和金小班的藏身之地道出了刘远还在沈冰手里的猜测。而卢定军正命令鬼影派快刀门追杀高飞，鬼影拒绝了卢定军，因为高飞曾经救过鬼影的命。
高飞和贺敏出来打探消息，不料在酒馆里遇到了被人派来找茬的一个洋人，二人大打出手，危急时刻，贺敏替高飞挡子弹，幸亏是虚惊一场，但高飞去记住了贺敏的这个人情。随后高飞和贺敏出门又遇到了袭击，二人配合默契打跑了敌人。高兴之余，二人去找在另一边打探消息的金小班，却不料中了敌人的调虎离山之计。高飞刚见到金晓班就被一伙人纠缠，而此时在巷子等待高飞的贺敏早已被掳走。随后，高飞和金小班拿着巷子里捡到的一个骰子来到云雨轩，封格格刚猜出了此物出自大通赌坊，便发现了暗中的狙击手，为救高飞，封格格被一枪击中，身负重伤。高飞来不及关心封格格便孤身一人来到大通赌坊，他将假钥匙交给了赌坊老板，顺利救出了贺敏。
暗中监视一切的卢定军和高飞都猜到了刘远还在沈冰手里。封格格和贺光辉街头告之高飞在等卢定军先出手，果不其然，卢定军随后便命鬼影追捕刘远，进行下一步计划。
贺敏将她和小班在照片墙发现的新线索告知高飞，高飞看着照片墙上琢磨着，此时封格格来到的高飞的住所，她注意到了照片墙上的一个女人，高飞却对她说他要主动找的是另一个女人——沈冰，因为他手里有她需要的东西。
特工003第8集剧情介绍沈冰在密室再次拷问刘远，刘远告知破解编码的关键是秋田真吉的一本手抄《周易》。而此时，卢定军已经拿到了这本《周易》，却毫无用处。沈冰正琢磨着刘远话的真假之时，刘远已在密室里打倒看守，逃了出去。而高飞和鬼影也都开始了行动。
沈冰发现刘远失踪时，高飞和鬼影已经来到了沈冰住所。蒙面的鬼影原本想劫持刘远，却不料刘远已逃出了狱，二人大打出手。正当刘远逃到大院之时，高飞挡住了他的去路，沈冰也赶来过来，突然一伙白脸人将高飞、沈冰，刘远三人包围。刘远手持炸弹开车逃跑却不料中了另一伙人的圈套。
高飞和沈冰被逼得躲进火药房里，性命攸关之际，高飞和沈冰紧紧相拥等待死亡，幸好，金小班和蒙面的封格格前来营救。沈冰不仅不感谢封格格的救命之恩，还要枪杀封格格，幸亏被高飞拦下。沈冰醋意大发，追问高飞封格格与他的关系，高飞并没有给她一个满意的答案。
顾明告知卢定军刘远跑了的消息，而卢定军却反映异常，十分淡定。地下党方面，因为刘远的失踪，而导致老宋对高飞提出了质疑。此时的高飞正带沈冰来到了自己的藏身之地，沈冰看到满屋子的如意摆，又想起了当年她与高飞的甜蜜过往和情丝万缕，原来高飞如今还爱着她，可是两个相爱的人却因不同的政治信仰而注定不能同路。
少洪波向卢定军打探刘远的消息，卢定军却有意隐瞒。老宋在贺光辉的陪同下正在破译编码;高飞、沈冰、贺敏和金晓班四个人共进晚餐，温馨而欢乐，不料此时，卢定军正拿起电话通知鬼影把刘远调到司令部，同时准备去会他的情人鬼影沈燕茹。
特工003第9集剧情介绍卢定军来到沈燕茹的住所，原来二人早已相恋多年。次日，卢定军告别沈燕茹去审问刘远，同时他察觉顾明和少洪波中有一个人格很有可能是共党。所以，当他发现顾明正在对刘远用刑拷问时，卢定军一反常态骂跑了顾明。事后，顾明跟少洪波提出卢定军正在防着他们，少洪波表面宽慰顾明，心里却另有打算。
封格格将少洪波传来的消息报告给贺光辉，说起高飞正跟沈冰在一起的事，封格格不禁有些许失落。高飞收到消息，刘远在卢定军手里，于是他跟沈冰等人商量计策。衡量再三，沈冰决定单枪匹马去司令部打探消息。
沈冰以特派员的身份大张旗鼓地拜访司令部，卢定军只得顺势列队迎接。沈冰与卢定军开门见山，兵戈相见，卢定军等人被沈冰的胆识魄力所震慑，无奈只能答应沈冰让她在司令部随意查看。就在卢定军和顾明担心沈冰察觉什么之时，他们收到了龙城商会的请柬。
卢定军派人将刘远怀有身孕的妻子带到了牢房与刘远相见，刘远被逼无奈只能退让。日军方面得知刘远不可靠的消息，决定找人干掉刘远。此时的高飞、沈冰、贺敏和金小班四人正研究着如何寻找军火的下落。而刘远却已经将寻找军火的途径都告诉了卢定军。
高飞等人备好枪械弹药，骑上机车去营救刘远，却不料卢定军一方早就派队伍暗中设下埋伏。在龙城商会宴席少洪波在贺光辉的掩饰下脱身，与封格格街头，封格格发现卢定军没来才意识到司令部很可能是个陷阱。
