展超和VIVIAN终于找到一个对地下室有一些了解的医院老勤杂工钱老，得到那里曾是一个实验室，十年前之发生爆炸毒气泄露，实验室还死了几个人。
包正和公孙泽查到了户主的名字叫王秋平，公孙泽想到了小Q电话。
这时四鼠已经炸开了地下实验室找到了毒气。
包正和公孙泽回到警局找到小Q，30，40，55这三个数字是破解的关键。
公孙泽想到这是和公孙亮经常玩的游戏，包正想到了是坐标是一个纬度坐标。现在离最后的时间还有一刻钟的时间。包正想到了当时箱子里有两件东西东西除了录音带还有手表，一定是手表时间指向的位置代表经度。公孙泽想起来了时间，地点确定到了文苑巷。
展超带着警员到地下实验室不过已经空空如也。包正三人终于找到了王秋平的下落。
第三题的答案就是王秋平，不过时间晚了，吴天告诉包正和公孙泽给他们两人一个机会，两人间死一人就可以救包妈和雪莉。
在吴天数到一的那一刻包正的枪打向了公孙泽。
包正想到了一切，这三道题只是一个圈套，孔雀王的目的就是找到王秋平。虽然不明白这一切是为了什么但王秋平一定是对孔雀王很重要的人。但包正没想到梦飞趁包正不注意把迷药打在包正身上。
这时吴天得到了想要的一切放了所有人质，吴天和四鼠也不见了。
包正被带着去见孔雀王，孔雀王脸上带着面具并且瘫在轮椅上。包正指出他们的目的就是要找到王秋平。
孔雀王告诉包正王秋平对他很重要，重要的不无法想像。包正猜到当年一定是公孙亮发现了这一点所以才被杀也是公孙亮把王秋平藏了起来。
孔雀王告诉包正自己之所以会变成这个样子一切都是公孙亮和王秋平所赐。这时梦飞进来在孔雀王身边耳语几句。孔雀王出去了。
吴天和四鼠把孔雀王需要的东西带了回来。吴天和孔雀王答应很快就会救好黄鼠的老婆。
包正被带到了王秋平的房间，包正问王秋平当年到底发生了什么。十年前王秋平是一句病理专家，医院里的一名主任。王秋平和当时在研究治疗鼠疫的办法。但没想到做实验室出了意外，学生拿错了试剂，实验室产生了病毒。
过了没多久孔雀王便派了两个人来抓王秋平，其中一个便是公孙亮。进到王秋平家后公孙亮杀了另外一个人告诉王秋平，孔雀眼抓他是为了让他制造出高级病毒。公孙亮要把王秋平带走藏起来。公孙亮把王秋平藏到了文苑巷，这也是公孙亮的高明之处当时孔雀王在出城的所有路口派了大量守卫。
新神探联盟第38集剧情介绍(大结局)孔雀王高调回归，包正猜是有人可以治好他的病了，包正以为是王秋平，但孔雀王告诉包正是他。
孔雀王要用换血的方法给自己治病，而包正血液正适合。
孔雀王抓王秋平来还是要他继续研究病毒，让王秋平恢复超级病毒。
吴天把四鼠和黄鼠老婆关在了一间封闭的房间并且开始往房间内释放毒气。四鼠一个一个倒下。
梦飞去看被绑在床上的包正。孔雀王后包正问他为什么要研究生化武器。孔雀王反问包正这世界上为什么会有很多人要研究武器，原子弹。是因为恐惧，怕被别人同化，被别人侵占。包正看着房间觉得很熟悉，孔雀王告诉他没错正是瑞鑫药业。
包正已经开始被抽血，治疗孔雀王的病需要一千毫升。展超他们也终于找到了瑞金药业。但警察遭到了吴天的埋伏。
关键时刻展超带人攻进瑞鑫药业，孔雀王让梦飞先守着包正。梦飞对包正很有感情，包正也一样。拉着梦飞的手说如果有下辈子她不要再做贼，自己也不做检查官，永远听她的，陪着她。梦飞为了救包正打倒了守卫。
王秋平没有帮孔雀王研制超级病毒，王秋平将病毒毁了并且把病毒自己喝了，王秋平死了。
孔雀王要离开的时候没想到公孙泽出现了，并且包正和梦飞都出现了。原来公孙泽的警徽一直在上衣口袋，公孙泽一枪打向了警徽。
梦飞不明白当时公孙泽和包正怎么会那么快达成默契。原来当时包正提醒公孙泽看王秋平的手表便明白了，王秋平的手表是公孙亮的。公孙泽明白了如果王秋平是杀害公孙亮的人不会一直带着手表。
孔雀王被人带着逃跑包正在后紧追，四鼠中唯一没死的白玉堂拦住了吴天。白玉堂亲手杀了吴天为兄弟报仇。
展超、公孙泽和包正联手在天台堵住了孔雀王。公孙泽要杀了孔雀王为自己的哥哥报仇。就在公孙泽要开枪的时候包妈跑上了天台。包妈知道孔雀王是谁。
包妈哭了，包妈说很多年没看过孔雀王了求孔雀王摘了面具。原来孔雀王就是包正的亲生父亲。包正不愿相信自己的父亲竟然会是这样一个人。
包正用枪指住了公孙泽让他放下枪。孔雀王让包正开他杀了公孙泽。而展超也举枪不知如何是好..........
