贺光辉和封格格提前撤离，留下高飞一人在云雨轩。卢定军来到云雨轩逼高飞承认射杀周专员，当高飞决定拼死一搏之时，沈冰带来了戴局长的指令，高飞竟然被任命为龙城侦缉队大队长。卢定军原本不相信沈冰，却接到了戴局长的电话，无奈只能接受事实，撤离了队伍。
沈冰告知高飞日军打算用细菌武器毁灭龙城，高飞为了龙城百姓的生命无奈答应与军统合作。封格格想留高飞住在云雨轩，而此时沈冰也前来告知，她以后也将住进云雨轩。二女一男在一个屋檐下的尴尬就此上演。
卢定军利诱警察局长要其待高飞上任后好好整治高飞。却不料，高飞上任第一天就大闹警局还把局长打了。高飞从被抓的一个小姑娘口中偶然得知了周专员被杀的线索。于是，高飞利用职务之便，大张旗鼓地抓获了卢定军亲卫队副队长的小舅子震东城，以分散卢定军的注意力，方便他暗中查找秋田的下落。不料，卢定军逼死了他的亲卫队副队长，并命沈燕茹派人混进警察局杀了震东城。
高飞得知震东城被杀的消息，决定接下来以维护治安的名义清剿了亲日商行逼秋田现身，而秋田虽大怒，却看穿了高飞想要引他现身的意图，于是他决定暂不行动，暗中观察。待秋田确认高飞手上有钥匙后，他决定派人联系当地可利用的势力——斧头帮试探高飞。警察局长向卢定军告高飞的状，不料，卢定军却说要支持高飞当青天大老爷。
密战龙城第15集剧情介绍高飞和沈冰分别收到了卢定军的邀请去参加舞会。沈冰的一身惊艳礼服装扮令高飞封然心动，回忆起了当年与其共舞拥吻的场面，二人关系缓和。卢定军在舞会上一边吹捧着高飞和沈冰，另一边派人将在门外等候他们的人挟持。高飞无奈只能配合卢定军在众人面前上演和谐的戏码。
日方重金雇佣斧头帮对付高飞。而贺光辉等地下党人正在开会，众人皆因高飞上任后的莽撞行为对其投了不信任票，只有封格格坚持相信他，此时，高飞突然找到了贺光辉地下党的联络点，将一封秘密的情报交给了贺光辉，终于获得了地下党员们的信任。
沈燕茹推断刘远很可能是日本人，而卢定军打算静观其变、坐收渔翁之利。斧头帮雨夜袭击高飞，高飞以寡敌众，将其打得一个个摊倒在地。日方见识了高飞的厉害，决定伺机而动。
高飞和沈冰商量着接下来的合作对策，而另一边卢定军偷偷谋划着设计嫁祸沈冰是杀死佟强的凶手，令高飞和沈冰二人反目。同时，日方也决定设下圈套对付高飞。
警察局长故意设计让高飞在证物箱里发现了佟强被杀的证物袋。此时，卢定军又计划找人假扮忍者刺杀高飞，嫁祸给日本人。高飞根据证物袋里的子弹怀疑沈冰是杀死佟强的凶手，沈冰气高飞对其不信任并没有否认，于是二人大打出手，怒气冲天的高飞想要置沈冰于死地，誓言与其决裂。突然，一伙蒙面黑衣人闯入刺杀二人，并故意告之是秋田指使的。一番交战后，果然，高飞在死者身上发现了忍者飞镖。高飞交代手下去顺清王府等待“老鱼头”的出现，随后才意识到沈冰不在身边，二人担心彼此的安危，焦急而担忧地寻找对方，割不断的感情无法掩藏，当发现彼此时，高飞却拿枪对准了沈冰。
密战龙城第16集剧情介绍高飞和沈冰暂时解除了误会，卢定军一方面安排警察局长继续监视高飞，一方面派人去顺清王府蹲点。而高飞收到消息，终于找到了老鱼头的踪迹。高飞和沈冰跟踪老鱼头，意外被忍者袭击。日方派出的忍者失利，于是他们决定找一个盟友合作对付高飞和沈冰。高飞发现云雨轩夜袭事件是卢定军在搞鬼，于是主动出击，带着沈冰和金小班去司令部逼卢定军说出他知道的关于刘远的一切。不料随后，秋田真吉也主动找上门威逼利诱卢定军与其合作，并告知他们计划将高飞的命结束在封门村。
沈冰收到面具人的指示去卧龙山找一个叫山猫的人。于是她想到了高飞警局曾逮捕的卧龙山土匪，不料土匪已被肖局长放走。赵二狗带人去封门村查探命案，随去警员却离奇死亡。正当高飞和沈冰在警局推测封门村之际，赵二狗慌张来报封门村有鬼的消息。
高飞和金小班决定去闹鬼的封门村一探究竟，此时，卢定军正谋划着在封门村暗中搞鬼。沈冰来到了卧龙山找山猫，没想到山猫居然是她的旧相识。山猫告知沈冰卧龙山的后山山洞里很有可能藏着日本人的秘密，而卧龙山大当家的蓝和尚是个厉害角色，有着非凡的军事才能。
高飞和金小班刚到封门村就遇到一户人家被射杀，生还的小女孩认定高飞和金小班是杀人的恶魔。而此时，沈冰决定和山猫一同上山，见一见大当家的蓝和尚，以说服他被军统收编。
