确实，如果根据史书的记载，堂堂一位开国之君，死后几天即下葬了，那么多分封在外地的王子都没有赶回来啊!这正常么?所以，朱棣在听说侄儿把他老子匆匆埋了后，十分恼火。谈迁的《国榷》记载，“燕王入临，将至淮安”，以为父亲奔丧为名，要找朱允炆讨说法，这为以后篡位找到了第一理由。《明皇大政记》记载，“故燕王移檄，亦有此句，且指以为罪。则葬之的据甚明。”
现在史学界大多认为，朱允炆确实是“速葬”了朱元璋。那朱允炆为什么敢冒天下之大不韪?有史书上称，这是朱元璋自己选择的时间，“故即位而葬，同日并举，皆高皇遗命，正以速葬消诸。”而秘史更称，朱允炆实际上在即位的前一天，即闰五月十五日把朱元璋给下葬了。这是“领命于地下”。这里说明朱元璋担心自己死后出乱子，留下遗言要朱允炆从速办自己丧事的。
朱允炆为什么要这样，除了“遵旨”，还有原因吗?急于即位?《皇明大政记》称，“并初虞致祭，不啻数坛，尚称皇太孙。宁有大葬无嗣皇帝主祭之理?”这里说的很明了了，也有道理，就是朱元璋刚死时，为他办事的朱允炆身份还是皇孙，这与礼制不符，老皇帝死了，怎么能没有新皇帝继位?国不可一日无君啊。
而从天气的角度考虑，速葬朱元璋也不无道理。南京素有“火炉”之称，闰五月时已是夏天了，很热了。不早早埋了，还想发臭?那决定下葬后又发生了什么?这同样是一个谜团。
在南京民间，连小孩子都知道这样的传说，朱元璋下葬那天出现了“迷魂阵”，就是南京的十三个城门同时出殡。此说法史书有记载，朱国桢的《皇明大政记》称，朱元璋下葬那天“而发引，各门下葬”。为什么要这样?在民间，有钱的大户人家，为了干扰视听，防止有人盗墓，有意隐藏先人埋葬地点，而一个皇帝如此这般，实在令人不解。
在元朝，帝王无陵寝，搞搞迷魂阵倒是很合乎情理，既然朱元璋生前都为自己的归宿找好了地方，选择紫金山阳的地块筑陵，谁不知道他葬在那里?有必要摆迷魂阵，大造假象吗?原来，在葬后不久即传出，朱元璋不是葬在孝陵，而独葬朝天宫。就是今天南京王府大街向南千米右手旁边的朝天宫，具体地点是“世传三清殿下为明祖真葬处”。
民间还有一个说法，来验明这个观点。据说当年孝陵内每到夜里就传出一个妇人的哭声，原来这是马皇后的哭声，后来大搞法事才没有了哭声。马皇后为什么要哭?说是一人空守一座孤坟，悲伤所致啊，“后来孝陵传夜哭，应缘马后悲孤独”，即是这个说法。
朝天宫，宋代时为天庆观，元代叫元妙观、永寿宫，朱元璋定都南京后，改为朝天宫，那时“百僚朝贺习仪于此”。葬在朝天宫这种说法，倒是给朱允炆“速葬”朱元璋、大摆迷魂阵、十三城门出殡找到了合理的解释和可能性，朝天宫在城里，速葬起来很方便的;如果葬在孝陵内，就没有必要搞假象。但后世好多学者都不信。
清代文人甘熙就不认可，其所着的《白下琐言》称，朱元璋花了几百万的银子，造了十几年(洪武九年即1376年，朱元璋决定在此建造自己的陵寝)，总不应该为马皇后一个人造的吧。而且，朱允炆是很讲孝道的一个仁义皇帝，也不忍心把朱元璋葬在陵外的地方啊 后来又传出，朱元璋不是葬在孝陵、也非朝天宫，离开了南京城，选葬在北京的万岁山。清人赵执信《万岁殿》称，“明祖手持一杯酒，布衣刘季真吾友(太祖祭历代帝王庙，惟汉高祖前加酒一杯，理由是只有刘邦和他一样，是从个平民老百姓当上皇帝的，即‘惟公与我起布衣而有天下’一说)。
后经考证，这是以讹传讹，不可信。甘熙即说，”万岁山在燕京，其时方以会葬不从，兴师靖难，焉有奉移梓宫不远数千里而往之事?“我也这样认为，如果真是这样，朱棣造反第一理由又从哪来?
但朱元璋到底是否真的葬在孝陵内，现在并没有学者能说”一定“二字。我曾向原在孝陵博物馆工作的中山陵园管理局文物处副处长廖锦汉先生请教过此事，廖称，在明孝陵”申遗“之前，中山陵园管理局曾专门请南京大学等相关的技术、史学专家，经数年科学探测、考古，证明明孝陵地宫未曾被盗，完好无损。
后来我再从相关专家处了解到，1998年开始，江苏省地震局地震工程研究院的专家在宝城内，采用无损磁测法(GPM技术)，已经明确发现在宝顶地下深处有一个面积达数千平方米的建筑空间，而且还找到了进入这个空间长达百米的通道(墓道)走向和入口，无疑宝顶下存在的这个巨大建筑空间只能是明孝陵的地宫，而地宫的入口就在明楼东侧十几米处现呈下沉错位、有裂口的宝城城墙下面。
朱元璋的遗体究竟有没有葬在明孝陵里，至今考古界仍没有定论。这个开国皇帝，死后尸骨在哪里都不知道，成为了一个未解之谜。
