碱性磷酸酶偏低的原因多是身体病理性的原因，发现碱性磷酸酶低的时候，要去医院就诊确定引起碱性磷酸酶低的原因，然后对症下药。
1、如果是因为贫血而引起碱性磷酸酶低，那么患者就要及时补血。增加食用含铁量高的食物， 注意多吃瘦肉、家禽、动物肝及血（鸭血、猪血）、蛋类等富铁食物。豆制品含铁量也较多。多吃富含叶酸食物，多吃有助于铁吸收的水果和蔬菜。
2、如果是因为儿童甲状腺性能不全引起的碱性磷酸酶偏低，那么家长就要及时带儿童到医院配合治疗。
3、如果是重症慢性肾炎引起的碱性磷酸酶偏低，患者一旦确诊为慢性肾炎，在开始阶段，都应该以休息为主，积极治疗，定期观察病情变化。
4、如果是病毒性感染时其活性在正常范围或略低引起的碱性磷酸酶偏低。多数病毒性疾病均能自愈，少数严重感染者可致死亡。尚缺乏特效治疗，仍以全身支持疗法和对症治疗为主。用抗生素或磺胺治疗无效，一些抗病毒药物如碘脱氧尿嘧啶核苷、阿糖腺苷、无环鸟苷对疱疹病毒感染等有一定疗效。
5、如果是营养不良、呆小症，维生素C缺乏症坏血病、乳糜泻、恶病质，遗传性低磷酸酶血症引起的碱性磷酸酶偏低，患者应适当补充营养，积极配合医生对症下药的治疗。
