阎立本在萧朝天的威逼下反口咬认狄仁杰是凶手，狄仁杰等人被押出门外处决，千钧一发被阎立本拦下，并当众说出了萧朝天才是凶手的真相，最终杀死了萧朝天。
洗刷冤屈后狄仁杰与阎立本、红巾蓝绫两姐妹辞行，与墨雨前往长安参加王浩德义妹王昭燕婚礼，却目睹了新娘王昭燕暴毙于婚礼现场的一幕，更令人震惊的是，新郎仇一帆竟是疑凶。
通天狄仁杰第3集剧情介绍狄仁杰告诉众人仇一帆不是杀害王昭燕的凶手令仇一帆放下心防，却不想狄仁杰却揭开了他杀了已怀孕的旧情人——常振风的妹妹这一真相。
并依江湖规矩让常振风杀了仇一帆报了杀妹之仇，为此常振风把长乐帮拱手相让送给狄仁杰。
事后狄仁杰安慰王浩德，并接受阎立本的邀请，调查一宗皇室密杀案，协助王浩德、蒋昊辰破解御医之死之谜，皇上下令三日之内查出真相，否侧将处死武媚娘。
为此，狄仁杰一行赶往感业寺。
通天狄仁杰第4集剧情介绍在感业寺，狄仁杰见到了太医的尸首，并为其自己掐死自己的死因震惊不已。
其后，他在普世殿见到了武媚娘，并向其了解了事件原委。狄仁杰前去找寻慕容清帮忙，王浩德却在搜寻普世殿时离奇出事。
慕容清用悬丝神针保住了王浩德的性命，却解不了毒。
一干人等再次求解媚娘，狄仁杰选择相信媚娘，慕容清因此吃醋，上街买了一个药铺决心研制这种毒，却被大理寺怀疑，两个时辰后将被收押，狄仁杰开始为证明清子无罪奔波。
通天狄仁杰第5集剧情介绍狄仁杰派墨雨常振风保护慕容清，自己前往普世殿搜寻证据。
在媚娘关心则乱的劝解中，狄仁杰冷静思考，找到了王昭燕的耳环，断定其没死。
而慕容清也在被捉压前研制出了毒药“捏死我的温柔”的样品，并说出了此毒与普世殿密杀一案有关。
感业寺内，慕容清说出了王昭燕的假死真相以及红尘六绝的厉害，狄仁杰也推测此案与王昭燕有关，并怀疑她有全城放毒的动机，王昭燕被通缉。
